VSCode で拡張機能の「phpcs」と「phpcbf」がインストールされている場合の例です。

phpcs.xml ファイルの作成

プロジェクトのルートディレクトリに phpcs.xml を作成します。※後で編集します。

root/　テーマとかプラグイン
　├ functions.php
　├ index.php
　├ style.css
　└ phpcs.xml // ← 新規作成

VSCode の setting.json でパス設定

VSCode でプロジェクト の setting.json 設定を開いて、「phpcs.standard」のパスに “./phpcs.xml” を指定する。

{
	"phpcs.standard": "./phpcs.xml"
}

phpcs.xml に除外ルールを記述する

ruleset name は変更してもOKです。

<?xml version="1.0"?>
<ruleset name="WordPress Custom Standard">
    <rule ref="WordPress">
        <!-- ここに除外ルールを追加していきます -->
    </rule>
    <exclude-pattern>/node_modules/*</exclude-pattern>
</ruleset>

記述例

除外に使えそうなものを一通り

<?xml version="1.0"?>
<ruleset name="WordPress Custom Standard">
    <rule ref="WordPress">

	<!-- ファイル名にアンダースコアが使えない。class-ではじめなければならないルールを除外 -->
        <exclude name="WordPress.Files.FileName" />

		<!-- 三項演算子を使えるようにする -->
        <exclude name="WordPress.PHP.DisallowShortTernary.Found" />

		<!-- コメントアウトしてもエラーが出ないようにする -->
		<exclude name="Squiz.PHP.CommentedOutCode.Found" />

		<!-- コメントの末尾にピリオドを付けなくてもいいようにする（日本語だもの） -->
		<exclude name="Squiz.Commenting.InlineComment.InvalidEndChar"/>

		<!-- Short Array Syntax [] を遣えるようにする -->
		<exclude name="Generic.Arrays.DisallowShortArraySyntax.Found" />

		<!-- if分を一行に書くことを許可する -->
		<exclude name="Generic.ControlStructures.InlineControlStructure.NotAllowed" />

		<!-- コメント書かないと許さないってのを無くす -->
		<exclude name="Squiz.Commenting" />
		<exclude name="Generic.Commenting" />

    </rule>
	<exclude-pattern>/node_modules/*</exclude-pattern>
	<exclude-pattern>/vendor/*</exclude-pattern>
</ruleset>

除外以外の便利そうなもの

<!-- Text Domain が適切なものになっているか ※my_text_domain に 自身のテーマやプラグインの text domainを入れる  -->
<rule ref="WordPress.WP.I18n">
	<properties>
		<property name="text_domain" type="array" value="my_text_domain"/>
	</properties>
</rule>

<!-- 関数名や変数名に独自のprefixが付与されているかチェック ※my_prefix に自身のテーマやプラグインの接頭辞を入れる -->
<rule ref="WordPress.NamingConventions.PrefixAllGlobals">
    <properties>
        <property name="prefixes" type="array">
            <element value="my_prefix"/>
        </property>
    </properties>
</rule>

<!-- サポートするWordPressのバージョン 下記の場合は5.0以上 -->
<config name="minimum_supported_wp_version" value="5.0"/>

参考

PHP_CodeSnifferのルールまとめ